- Αφιέρωμα στον Μίκη Θεοδωράκη - Με την ορχήστρα των χρωμάτων (2009)
- Μύθοι γυναικών (2008)
- Mosaic (2004)
- Η ποίηση στο ελληνικό τραγούδι (2003)
- Μπλε (2003)
- Οι μεγαλύτερες επιτυχίες της (2002)
- Του φεγγαριού τα πάθη - Federico Garcia Lorca (2002)
- Ένας αιώνας ελληνικό τραγούδι (2001)
- Mauthausen Trilogy (2000)
- Nostalgia (2000)
- Η τρίτη πόρτα (2000)
- Ήλιος και χρόνος (Sun and time) (1999)
- Symphonietta - État de Siège (1999)
- Σερενάτες (1998)
- Άσματα (1998)
- Αρκαδίες I,VII,VIII (Ηχογραφήσεις από τα χρόνια της εξορίας) (1997)
- Poetica (1996)
- The birthday concert '95 (1995)
- Η Μαρία Φαραντούρη τραγουδά Lucio Dalla (1995)
- Η Βεατρίκη στην οδό μηδέν (1994)
- The very best of Maria Farandouri (1990)
- 17 τραγούδια (1990)
- Σκοτεινή μητέρα (1986)
- Η Μαρία Φαραντούρη στο Olympia (1985)
- Η Φαραντούρη τραγουδάει Λιβανελί (1982)
- Ο επιβάτης (1981)
- Η εποχή της Μελισσάνθης (1980)
- Η αγάπη είναι ο φόβος... (1980)
- Lieder aus Griechenland (1980)
- Maria Farantouri Live (1979)
- Οι γειτονιές του κόσμου (1979)
- Η Μαρία Φαραντούρη τραγουδάει Μπρεχτ (1979)
- Τραγούδια διαμαρτυρίας από όλο τον κόσμο (1977)
- Τα Παράλογα (1976)
- Η μεγάλη αγρύπνια (1975)
- Canto General (1975)
- Τα Νέγρικα (1975)
- Ο ήλιος και ο χρόνος - Κύκλος ποιημάτων του Μίκη Θεοδωράκη (1975)
- Η Ελλάδα του Μίκη Θεοδωράκη (1974)
- Αρκαδία 6 - 8 (1974)
- 18 λιανοτράγουδα της πικρής πατρίδας (1973)
- Τα τραγούδια του Αγώνα (1971)
- Songs and guitar pieces by Theodorakis (1971)
- Θεοδωράκης διευθύνει Θεοδωράκη Vo2 (1971)
- Κατάσταση πολιορκίας (1970)
- Πνευματικό εμβατήριο - Οιδίπους τύραννος (1970)
- Ένας όμηρος (1967)
- The ballad of Mauthausen / Six songs (1966)
- Η Μαρία Φαραντούρη τραγουδά Μίκη Θεοδωράκη (1965)
- Ζωντανές εκτελέσεις
